1.Flag抗体
Flag标签是利用基因工程技术使目标蛋白带上一段特定的氨基酸序列( 即DYKDDDDK)，形成flag标签与目标蛋白的融合蛋白。由于FLAG标签尺寸小，且具有亲水特性，因此其通常依附于融合蛋白的表面，对融合蛋白的功能、性质影响极小。Flag抗体可以检测位于蛋白N-末端、C-末端或位于融合蛋白内部的Flag标签 (DYKDDDDK)，被广泛应用于研究Flag标签融合蛋白的检测和纯化、寻找相互作用的蛋白质、探索蛋白质的结构和功能等。
2.His抗体
His标签是由6个组氨酸 (His-His-His-His-His-His) 组成的短肽，专门设计用于重组蛋白质的吸附纯化。由于分子量较小，并且较容易分离和纯化，His融合标签与其他标签相比有很多明显优势，是目前用于纯化的融合标签中使用最为广泛的一种。利用His标签可以建立一个基于融合蛋白的高效检测和纯化系统。His抗体可以用于检测和His标签融合表达蛋白的表达、细胞内定位，以及纯化、定性或定量检测His融合表达蛋白等。
3.Myc抗体
Myc标签是一个具有11个氨基酸的短肽 (序列为EQKLISEEDL)，可放在C端或N端，已成功应用于WB杂交技术、免疫沉淀IP和流式细胞术中。Myc的低pH洗脱条件会降低蛋白质的活力，因此常用于检测，少用于纯化。用于检测重组蛋白在靶细胞中的表达。Myc抗体能与靶蛋白上的Myc标签相互作用，并特异性地识别Myc标记的靶蛋白。
